До первого февраля ЕГАИС принимала документы старой версии 2.0 и новой 3.0. Помарочную продукцию разрешалось производить и отгружать с указанием неполного количества марок. ЕГАИС не контролировала факт наличия марок на остатках других организаций.

С 01.02.2018 года до 01.07.2018 года. С первого февраля до первого июля производство и импорт запретят учитывать по второму протоколу. Производители и импортеры станут вести учет исключительно в помарочном режиме (ЕГАИС 3.0). Но на этом этапе еще разрешается помарочную продукцию отгружать с указанием неполного количества марок. Росакогольрегулирование не будет наказывать розницу и общепит за ошибки и недочеты в учете.

С 1.07.2018 все без исключения организации перейдут к помарочному учету алкоголя. В отчетах о производстве станет указываться количество штриховых кодов, равное количеству производимых бутылок. ЕГАИС 3.0 не позволит отгружать продукцию с указанием неполного количества марок, а также дублировать марки. Поставить на баланс продукцию, по штриховому коду которой была продажа или другое списание, станет невозможно.